Önemli Tarihler
KURSLAR HAKKINDA GENEL BİLGİ
Kurslar 2-4 Eylül 2024 tarihleri arasında Erciyes Üniversitesi Biyofizik AD ve Deneysel Araştırmalar Uygulama ve Araştırma Merkezi (DEKAM)’nde beş uygulamalı kurs olarak düzenlenecektir. Bir kursiyer en fazla iki kursa katılabilir. Kurslarla ilgili föyler katılımcılara verilecektir. Kurs ücretine, kursiyerlerin öğle yemeği dahildir.
Kursu Düzenleyenler
Prof. Dr. Bahar GÜNTEKİN, İstanbul Medipol Üniversitesi
Doç. Dr. Fazile CANTÜRK TAN, Erciyes Üniversitesi
Doç. Dr. Güven AKÇAY, Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
Arş. Gör. Dr. Sümeyye UÇAR, Erciyes Üniversitesi
Arş. Gör. Salih VAROL, Erciyes Üniversitesi
Ayşenur AKAN, İstanbul Medipol Üniversitesi
Kardelen TUR, Erciyes Üniversitesi
Emre TUFAN, Erciyes Üniversitesi
Dr. Mustafa ERMİŞ
1. Kurs: Tek Hücre Jel Elektroforez (Comet Assay)
Kursiyer Sayısı: 7 Kişi
Kurs Saati: 18 saat (4 saat teorik ve 14 saat uygulama)
Kurs Ücreti: 3000 TL
Kursun Yeri: Tıp Fakültesi Biyofizik AD araştırma laboratuvarı
Kurs Eğitmeni: Doç. Dr. Fazile CANTÜRK TAN
Arş. Gör. Salih VAROL
Kardelen TUR
Kursun Amacı: Bu kursun temel amacı, kan, hücre hattı ve doku örneklerinde tek hücre düzeyinde DNA hasarı/tamiri belirlemektir.
Comet assay ya da tek hücre jel elektroforezi (SCGE), DNA denatüre olduğunda tek hücre düzeyinde tek ve çift sarmal kırılmalarını tespit edebilen basit, ucuz ve hızlı bir tekniktir. Bu analiz ilk olarak 1984 yılında Ostling ve Johansson tarafından geliştirilmiş ve daha sonra Singh ve arkadaşları tarafından revize edilmiştir. DNA kırılmaları ışınlama, toksik maddeler veya kimyasalların bir sonucu olarak meydana gelebilir. Bu teknik karsinogenez, genotoksisite, radyoterapi, ışınlanmış gıdaların görüntülenmesi ve çevresel biyogörüntüleme gibi birçok alana uygulanabilmekte ve birçok araştırma alanında kullanılabilmektedir. Comet assay, tek hücre kullanılarak in vitro veya tek bir hücre süspansiyonunda herhangi bir doku için in vivo olarak gerçekleştirilebilir.
Kursun sonunda;
1. Genel laboratuvar cihazlarını tanıyacak,
2. Analizler için gerekli olan tamponları hazırlayabilecek,
3. Kandan ve dokudan hücreleri izole edebilecek,
4. In vivo ve in vitro DNA hasarını/tamirini değerlendirebilecek,
02.09.2024 Pazartesi
- 8.30-9.30 DNA hasarı genel teorik bilgi
- 9.30-9.45 Coffee Break
- 9.45-10.45 DNA comet analiz yönteminin temel prensipleri ve uygulama alanları
- 10.45-11.00 Coffee Break
- 11.00-12.00 Comet assay görüntü analiz sistemi
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-15.00 Cihazlar ve kimyasalların tanıtılması, tamponların hazırlanması
- 15.00-17.00 Lamların ön kaplanması
03.09.2024 Salı
- 8.30-10.30 Tam kandan lenfosit izolasyonu
- 10.30-11.00 Hela hücre hattından örneklerin izolasyonu
- 11.00-12.00 Rat dokusundan hücrelerin izolasyonu
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-15.30 Hücrelerin lamlara kaplanması
- 15.30-16.00 Parçalama
- 16.00-16.30 Elektroforez
- 16.30-17.00 Nötralizasyon
04.09.2024 Çarşamba
- 8.30-9.30 Lamların boyanması
- 9.30-11.00 Görüntüleme ve analiz
Kursiyer Sayısı: 7 Kişi
Kurs Saati: 16 saat (4 saat teorik ve 12 saat uygulama)
Kurs Ücreti: 5000 TL
Kursun Yeri: Tıp Fakültesi Biyofizik AD araştırma laboratuvarı
Kurs Eğitmeni: Arş. Gör. Dr. Sümeyye UÇAR
Emre TUFAN
Kursun Amacı: : Temel hücre kültürü tekniklerindeki tüm basamaklarını uygulamak ve kurs sonunda çalışmalarda kullanılabilecek genel hücre kültürü bilgisini katılımcılara vermektir.
Doku kültürü, hem organ kültürü hem doku eksplant kültürleri hem de hücre kültürü için kullanılan genel bir terimdir. Doku (hücre) kültürü, dokuların ve hücrelerin canlının dışında besiyerleri kullanılarak in vitro şartlarda devamının sağlanmasıdır. Hücre kültürü ilk defa 1907 yılında Ross Harrison tarafından gerçekleştirilmiş olsa da, 1950' den sonra çeşitli keşiflerinde gerçekleşmesiyle gelişmeler yaşanmıştır. Hücre kültürü, hücrelerin bir laboratuvar ortamında kontrol altında büyütülmesini sağlar. Bu, deneylerde tekrarlanabilir sonuçlar elde etmek ve hücreler üzerinde kontrol sahibi olmak için önemlidir. Aynı zamanda ilaç testleri ve diğer deneysel müdahaleler gibi çeşitli manipülasyonlara tabi tutulabilmesini sağlar. Bu, hücrelerin davranışını, büyümesini ve farklılaşmasını anlamak için kullanışlıdır. Çeşitli avantajları olduğu için hücre kültürü çalışmaları literatürde önemli bir yer almaktadır.
Kursun sonunda;
1. Hücre kültürü laboratuvar cihazlarını tanıyacak,
2. Hücre kültürü besiyerini hazırlayabilecek,
3. Hücreleri mikroskop altında görüntüleyip sayabilecek,
4. Hücreleri mikroskop altında görüntüleyip sayabilecek,
02.09.2024 Pazartesi
- 8.30-9.30 Hücre kültürü ve uygulama alanları
- 9.30-9.45 Coffee Break
- 9.45-10.45 Besiyer hazırlama ve hücre çözme/dondurma teknikleri
- 10.45-11.00 Coffee Break
- 11.00-12.00 Pasajlama ve çoğaltma teknikleri
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-17.00 Hücre kültüründe kullanılacak kimyasalların/sarf malzemelerin hazırlanması ve cihazların tanıtılması
03.09.2024 Salı
- 8.30-10.30 Hücrelerin çözdürülmesi ve thoma lamında sayılması
- 10.30-12.00 Hücre besiyeri hazırlanması
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-15.00 Hücrelerin besiyerine ekilmesi
- 15.00-16.00 Hücrelerin mikroskopta görüntülenmesi
- 16.00-17.00 Hücrelerin pasajlanması ve dondurulması
Kursiyer Sayısı: 7 Kişi
Kurs Saati: 14 saat (4 saat teorik ve 10 saat uygulama)
Kurs Ücreti: 5000 TL
Kursun Yeri: Tıp Fakültesi Biyofizik AD araştırma laboratuvarı
Kurs Eğitmeni: Doç. Dr. Fazile CANTÜRK TAN
Kursun Amacı: : Bu kursun amacı, katılımcılara DNA ve RNA izolasyonu tekniklerini öğretmek ve bu tekniklerin biyoteknoloji ve genetik araştırmalardaki kritik rollerini vurgulamaktır.
DNA ve RNA izolasyonu, genetik analizler, gen ekspresyon çalışmaları, cDNA sentezi, RT-PCR ve çeşitli moleküler biyoloji çalışmalarının temelini oluşturur. Kurs boyunca katılımcılar, farklı biyolojik örneklerden (doku, kan örnekleri, bitki ve hayvan hücreleri gibi) yüksek kaliteli DNA ve RNA izolasyonunu nasıl gerçekleştireceklerini öğreneceklerdir. Bu kurs, moleküler biyoloji, genetik, biyokimya ve ilgili alanlarda çalışan öğrenci ve araştırmacılar için tasarlanmıştır. Hem teorik bilgi hem de pratik beceriler kazandırarak, katılımcıların laboratuvar ortamında DNA ve RNA izolasyonu konusunda yetkinlik kazanmalarını hedeflemektedir. Kurs sonunda katılımcılar, yüksek kaliteli DNA ve RNA izolasyonu ve analizi ile ilgili temel teknikleri güvenle uygulayabilecek bilgi ve deneyime sahip olacaklardır.
02.09.2024 Pazartesi
- 8.30-9.30 DNA ve RNA genel teorik bilgi
- 9.30-9.45 Coffee Break
- 9.45-10.45 DNA/RNA izolasyonu
- 10.45-11.00 Coffee Break
- 11.00-12.00 DNA/RNA izolasyonu için kullanılacak kimyasalların/sarf malzemelerin ve cihazların tanıtılması
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-15.00 Kimyasal ve tamponların hazırlanması
03.09.2024 Salı
- 8.30-10.00 DNA izolasyonu için hücre lizisi ve homojenizasyon işlemleri
- 10.00-12.00 RNA izolasyonu için hücre lizisi ve protein ve diğer bileşenlerin uzaklaştırılması
- 12.00-13.00 Öğle yemeği
- 13.00-14.30 Protein ve diğer bileşenlerin uzaklaştırılması
- 14.00-15.30 DNA çöktürme
DNA saflaştırma ve konsantrasyon tayini - 15.30-17.00 RNA çöktürme
RNA saflaştırma ve konsantrasyon tayini
Kursiyer Sayısı: 10 Kişi
Kurs Saati: 4 saat (2 saat teorik ve 2 saat uygulama)
Kurs Ücreti: 750 TL
Kursun Yeri: Deneysel Araştırmalar Uygulama ve Araştırma Merkezi (DEKAM)
Kurs Eğitmeni: Doç. Dr. Öğr. Güven AKÇAY, Dr. Mustafa ERMİŞ
Kursun içeriği: Vücudun sinir sistemiyle ilgili hastalıklar, nörolojik hastalıklar olarak bilinmektedir. Beyin, omurilik ya da sinirlerin elektriksel yapısındaki anormallikler birçok soruna yol açtığı için nörolojik hastalıklar tüm vücut sistemlerini etkileyebilmektedir. Nörolojik hastalıklar, kalp hastalıklarından sonra ölümlerin ikinci önde gelen nedenidir ve dünya genelinde insidansı ve prevelansı oldukça yüksektir. Santral sinir sisteminin karmaşık yapısı ve kompleks sinyal yolakları hastalıkların nörobiyolojisini ve patofizyolojisini anlamayı zorlaştırdığı gibi bu hastalıklara yönelik radikal tedavilerin geliştirilmesinin de önünü kapatmaktadır. Nörolojik hastalıkların mekanizmalarının anlaşılması, bu hastalıkların önlenmesi ve etkin tedavi yöntemlerinin uygulanmasında deneysel çalışmalar önemli rol oynamaktadır. Hayvan modelleri kullanılarak yapılan araştırmalar, bu hastalıkların mekanizmalarını aydınlatabilmek ve etkin tedavi stratejileri geliştirebilmek için hayati rol oynamaktadır. Bir tedavi yönteminin araştırılmasında, yeni tedavi protokollerinin geliştirilmesinde ve yeni ilaç moleküllerinin keşfedilmesinde kemirgenler (fare, sıçan, gerbil gibi) ve kemirgen olmayan memeliler (köpek, tavşan, kedi, domuz, şempanze gibi) kullanılmaktadır. Hayvan modellerinde hem normal hem de anormal beyin fonksiyonunun temel nöronal mekanizmaları araştırılmaktadır. Bu çalışmalarda model oluşturulurken veya ilaç enjeksiyonu yapılırken hayvanların beyin atlasına göre sterotaksik koordinatlara göre işlemler yapılır. Özellikle nörolojik hastalıklar olan Alzheimer, Epilepsi, Migren, Parkinson vs. gibi modeller sterotaksi kullanılarak yapılmaktadır. Önerilen bu kursta da sterotaksik koordinatların (anteroposteriyor, lateral ve vertikal) beyin atlasından belirlenmesi, sıçan beyin atlasının okunması, beyin bölgelerinin sterotaksik koordinatlarının saptanması, beyne ilaç enjeksiyonunun yapılması, EEG, LTP gibi elektrofizyolojik kayıtların alınmasında sterotaksinin kullanımı teorik ve uygulamalı olarak anlatılacaktır.
Kursun sonunda;
1. Rat/mouse beyin atlasının okunması,
2. Rat/mouse beyin atlasından sterotaksik koordinatların belirlenmesi ve koordinatlarının saptanması,
3. EEG, LTP gibi elektrofizyolojik kayıtlar için elektrot/vida yerleştirilmesi,
4. Beyne ilaç enjeksiyonunun yapılması,
5. Sterotaksi kimyasal ajanlar ile Alzheimer, Epilepsi, Migren, Parkinson vs. gibi model oluşturulmasının öğretilmesi hedeflenmektedir.
03.09.2024 Salı
- 13.00-15.00 Teorik bilgi
- 15.00-17.00 Sterotaksik uygulamalar
Kursiyer Sayısı: 30 Kişi
Kurs Saati: 3 saat (1 saat teorik ve 2 saat uygulama)
Kurs Ücreti: 750 TL
Kursun Yeri: Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Derslikleri
Kurs Eğitmeni: Prof. Dr. Bahar GÜNTEKİN
Ayşenur AKAN
Kursun Amacı: : Bu kursta EEG dinlenim durumu ve EEG olaya ilişkin osilasyonların genel teorik bilgileri anlatılacak, sonrasında EEG analizlerinin temelleri uygulamalı olarak bilgisayar ortamında gösterilecektir.
Kursun Akışı:
Teorik: Prof. Dr. Bahar GÜNTEKİN
EEG nedir, EEG çekimi prensipleri, EEG dinlenim durumu aktivitesi, EEG Olaya ilişkin Potansiyeller, EEG Olaya ilişkin Osilasyonlar , Sağlıklı kişilerde ve farklı patolojilerde dinlenim durumu aktivitesi, Sağlıklı kişilerde ve farklı patolojilerde EEG olaya ilişkin osilasyonlar, EEG Beyin osilasyonları modülasyonları, EEG Olaya ilişkin Beyin osilasyonları kognitif süreçlerin araştırmasında kullanım örnekleri
Teorik: Ayşenur AKAN
1. EEG Analizine Giriş:
- EEG verileri ve önemi hakkında genel bilgi.
- BrainVision Analyzer ve EEGLAB Toolbox tanıtımı.
- Ham EEG verilerini analiz programlarına aktarma.
- Filtre uygulama ve artefaktları temizleme.
- Verileri epoklara ayırma.
- Güç spektral yoğunluğu (PSD) hesaplama.
- Farklı frekans bantlarını analiz etme.
- EEG verilerinde olayları/uyaranları belirleme/seçme.
- Uyaranlar (stimulus) etrafında epok oluşturma
- Zaman-frekans analizi yapma.
- Temel istatistiksel yöntemler.
- EEG verilerini ve sonuçlarını görselleştirme.
- Topografik haritalar oluşturma.
- BrainVision Analyzer
- EEGLAB Toolbox: EEG analizi için ücretsiz MATLAB analiz aracı.
- Eğitimler ve Dokümantasyon: [EEG Lab eğitimleri ve dokümantasyon bağlantıları]
09.00-10.00 Teorik bilgi
10.00-10.15 Coffee Break
10.15-12.00 Pratik bilgi
